Σαν σήμερα το 1976, γράφτηκε ένα σημαντικό κεφάλαιο στην πολύκροτη υπόθεση της μεταγραφής του Θωμά Μαύρου από τον Πανιώνιο στην ΑΕΚ, μια ιστορία που είχε τραβήξει σε μάκρος και είχε φτάσει μέχρι τις δικαστικές αίθουσες.
Ο Πανιώνιος υποστήριζε ότι διατηρούσε τα δικαιώματα του ποδοσφαιριστή, βασιζόμενος σε δελτίο που είχε υπογράψει όταν ο Μαύρος ήταν μόλις 11 ετών, χωρίς μάλιστα την έγγραφη συναίνεση του πατέρα του. Από την πλευρά της, η ΑΕΚ είχε έρθει σε συμφωνία με τον παίκτη ήδη από τα τέλη του 1975, εκμεταλλευόμενη το νομικό κενό γύρω από την εγκυρότητα εκείνης της αρχικής υπογραφής.
Η διαμάχη οδήγησε σε αλλεπάλληλες δικαστικές αποφάσεις, με το Πρωτοδικείο να δικαιώνει αρχικά τη μία και στη συνέχεια την άλλη πλευρά, ύστερα από εφέσεις του Πανιωνίου. Η εμπλοκή αυτή δημιούργησε ένα πρωτοφανές αδιέξοδο, καθώς η ΕΠΟ εξέδιδε πότε δελτίο στον έναν σύλλογο και πότε στον άλλον, με αποτέλεσμα ο ποδοσφαιριστής να μείνει ουσιαστικά εκτός δράσης για ολόκληρη τη σεζόν 1975-76.
Τελικά, εκείνη την περίοδο επήλθε συμφωνία ανάμεσα στον Λουκά Μπάρλο και τον Τσολακάκη, με οικονομικό αντάλλαγμα περίπου 4 εκατομμύρια δραχμές, την τέλεση έξι φιλικών αγώνων και την παραχώρηση δύο ποδοσφαιριστών (ενός επαγγελματία και ενός ερασιτέχνη). Έτσι, ο Μαύρος φόρεσε τη φανέλα της ΑΕΚ και ξεκίνησε μια λαμπρή πορεία.
Με την Ένωση κατέκτησε δύο πρωταθλήματα και δύο κύπελλα, ενώ αποτέλεσε βασικό μέλος της ομάδας που έφτασε μέχρι τα ημιτελικά του Κυπέλλου UEFA. Αναδείχθηκε πρώτος σκόρερ του ελληνικού πρωταθλήματος τρεις φορές (1978, 1979, 1985), ενώ το 1979 κατέκτησε τη δεύτερη θέση στην Ευρώπη, κερδίζοντας το ασημένιο παπούτσι.
Παρέμεινε στην ΑΕΚ μέχρι το 1987, χρονιά κατά την οποία ο τότε προπονητής Νίκος Αλέφαντος ουσιαστικά τον έθεσε εκτός ομάδας, με τη διοίκηση να ακολουθεί την ίδια κατεύθυνση. Ωστόσο, ο Μαύρος απάντησε εντυπωσιακά, επιστρέφοντας στον Πανιώνιο για δύο σεζόν, όπου κατέγραψε 89 συμμετοχές και 51 γκολ, ενώ το 1990 αναδείχθηκε ξανά πρώτος σκόρερ του πρωταθλήματος.
Συνολικά με την ΑΕΚ αγωνίστηκε σε 345 επίσημους αγώνες και σημείωσε 224 τέρματα, αφήνοντας ανεξίτηλο το στίγμα του στην ιστορία του συλλόγου και του ελληνικού ποδοσφαίρου.
